As cores encontradas nos corais coloridos são principalmente devido a três coisas: pigmentos fotossintéticos, proteínas fluorescentes e cromoproteínas não fluorescentes.
Acredita-se que os pigmentos desempenham um papel importante na saúde e resiliência dos corais e como os corais podem interagir com o meio ambiente.
Quando os corais são estressados por mudanças nas condições tais como temperatura, luz ou nutrientes, eles expulsam as algas simbióticas que vivem em seus tecidos, fazendo com que elas se tornem completamente brancas.